Bệnh sốt rét 

Xanh methylene được xác định bởi Paul Ehrlich năm 1891 như là một điều trị có thể đối với bệnh sốt rét. Nó biến mất như một loại thuốc chống sốt rét trong chiến tranh Thái Bình Dương ở vùng nhiệt đới, bởi vì những người lính Mỹ và Đồng Minh không thích hai tác dụng phụ nổi bật của nó, nhưng có thể đảo ngược được: chuyển nước tiểu màu xanh hoặc xanh lá cây, và da trắng (mắt trắng). Gần đây, sự quan tâm đến việc sử dụng thuốc chống sốt rét đã được hồi sinh, đặc biệt là do giá thành thấp. Một số thử nghiệm lâm sàng đang được tiến hành, cố gắng để tìm một sự kết hợp thuốc thích hợp. Theo các nghiên cứu về trẻ em ở Châu Phi, dường như nó có hiệu quả chống lại bệnh sốt rét, nhưng những nỗ lực để kết hợp màu xanh methylene với chloroquine là đáng thất vọng.

Bệnh Alzheimer

Xanh methylene đã được điều tra để điều trị bệnh Alzheimer (sa sút trí tuệ). Xanh methylene được đề xuất có ảnh hưởng đến sự thoái hóa thần kinh trong bệnh Alzheimer thông qua sự ức chế sự kết hợp protein tau. Xanh methylene cũng ảnh hưởng đến sự phân ly của amyloid TauRx Therapeutics đã định hình lại loại thuốc này dưới nhãn hiệu LMTX. Công thức này đang được thử nghiệm lâm sàng giai đoạn 3 về tính an toàn và hiệu quả như "TRx0237". LMTX giải quyết một số mối quan tâm về đáp ứng liều đã được đưa ra trước đó trong nghiên cứu.

Rối loạn lưỡng cực 

Xanh methylene đã được nghiên cứu như là một thuốc bổ trợ trong điều trị rối loạn lưỡng cực.  

Virus

Nó đã được nghiên cứu về bệnh sarcoma của Kaposi, virut West Nile liên quan đến AIDS, và để khử hoạt hóa staphylococcus aureus và HIV-1. Thuốc nhuộm và ánh sáng của Phenothiazine được biết là có đặc tính virut trong hơn 70 năm.